Strona domowa
Uniwersytet Warszawski Wydzial Fizyki
ENGLISH VERSION  Badania    Osoby    Edukacja

Imię i Nazwisko: dr Jacek Jemielity
Adres: Zakład Biofizyki, Instytut Fizyki Doświadczalnej, Uniwersytet Warszawski, Zwirki i Wigury 93, 02-089 Warszawa
Telefon: +48 22 5540774,
lub +48 22 5540788
E-mail: jacekj@biogeo.uw.edu.pl
Tematyka badawcza: Synteza modyfikowanych analogów końca 5' mRNA oraz innych nukleotydów i nukleozydów o znaczeniu biologicznym. Badania nad rolą kapu w procesie translacji. Właściwości inhibitorowe analogów kapu w procesie biosyntezy białka. Synteza związków znakowanych izotopowo oraz ich zastosowanie do badań mechanizmów reakcji enzymatycznych.
Wykształcenie i doświadczenie zawodowe:
Czerwiec 1997 Magister Chemii - Chemia Organiczna, Wydział Chemii Uniwersytetu Warszawskiego
Styczeń 2002 Doktor Chemii - Chemia Organiczna, Wydział Chemii Uniwersytetu Warszawskiego
Lipiec 2002 Institute of Structural Biology, Grenoble, Francja (1 miesiąc), badania nad inhibicją biosyntezy białka przy użyciu analogów kapu
Luty 2002 - Wrzesień 2002 Zakład Biofizyki, Instytut Fizyki Doświadczalnej, Uniwersytet Warszawski; specjalista naukowo techniczny
Czerwiec-Sierpień 2003 University of Turku, Turku, Finlandia (3 miesiące), Synteza w fazie stałej oligonukleotydów posiadających na końcu 5' strukturę kapu
Październik 2002 Zakład Biofizyki, Instytut Fizyki Doświadczalnej, Uniwersytet Warszawski; adiunkt
Zgłoszenia patentowe:
  • Jemielity J., Grudzien-Nogalska E., Kowalska J., Darzynkiewicz E., Rhoads R.E "Synthesis and use of anti-reverse phosphorothioate analogs of the messenger RNA cap" United States Provisional Application nr 60/944,842, 19 czerwca 2007, które zostało przekształcone w dniu 19 czerwca 2008 w zgłoszenie non-provisional USA oraz w zgłoszenie światowe w trybie PCT nr. PCT/US2008/67494
  • Jemielity J., Grudzien-Nogalska E., Kowalska J., Darzynkiewicz E., Rhoads R.E. "Cząsteczka RNA oraz sposób otrzymywania peptydów lub białka", zgłoszenie do Urzędu Patentowego RP, 19 czerwca 2007, Nr P 382703
  • Kowalska J. Jemielity J., Darżynkiewicz E., Łukaszewicz M., Żuberek J. "Nowe boranofosforanowe analogi dinukleozydów, ich zastosowanie, cząsteczka RNA, sposób otrzymywania RNA, oraz otrzymywania peptydów lub białka." zgłoszenie do Urzędu Patentowego RP 6 czerwca 2008, Nr P 385388
  • Kowalska J. Jemielity J., Darżynkiewicz E., Rhoads R.E., Lukaszewicz M., Zuberek J. "mRNA Cap Analogs". zgłoszenie światowe w trybie PCT 4 czerwca 2009, nr PCT/US2009/046249
Nagrody i wyróżnienia:
  • Nagroda Wydziału Fizyki Uniwersytetu Warszawskiego im. Rektora Grzegorza Białkowskiego: zespół w składzie: dr Joanna Żuberek, mgr Joanna Kowalska, dr Jacek Jemielity za "projektowanie i chemiczne syntezy analogów kapu (tj. końca 5' mRNA) oraz biofizyczne badania ich oddziaływań z czynnikami białkowymi - grudzień 2008r
  • Stypendium tygodnika Polityka pod hasłem "Zostańce z nami" VIII edycja - pazdziernik 2008r
  • Nagroda Rektora UW III stopnia za osiągnięcia naukowe - 2004r
  • Stypendium Rektorskie UW w latach 2004, 2005, 2006, 2007
Udział w projektach:
Rola końców 5' mRNA i 5' U snRNA (tzw. struktur kapu) w regulacji ekspresji genu

Wybrane publikacje (1998-2009)
    2009:

  1. Kowalska J., Lukaszewicz M., Zuberek J., Darzynkiewicz E., Jemielity J.; Phosphoroselenoate Dinucleotides for Modification of mRNA 5' End. ChemBioChem 10, in press, DOI: 10.1002/cbic.200900522 (Published Online: Sep 8 2009)
  2. Rydzik A.M., Lukaszewicz M., Zuberek J., Kowalska J., Darzynkiewicz Z.M., Darzynkiewicz E., Jemielity J.; Synthetic dinucleotide mRNA cap analogs with tetraphosphate 5,5 bridge containing methylenebis(phosphonate) modification Org. Biomol. Chem. 7, in press, DOI: 10.1039/b911347a (Published Online: Sep 7 2009)
  3. Zdanowicz A., Thermann R., Kowalska J., Jemielity J., Duncan K., Preiss T., Darzynkiewicz E., Hentze M.W.; Drosophila miR2 Primarily Targets the m7GpppN Cap Structure for Translational Repression. Molec. Cell 35, 881-888 (2009).
  4. Kowalska J, Lukaszewicz M, Zuberek J, Ziemniak M, Darzynkiewicz E, Jemielity J.; Phosphorothioate analogs of m7GTP are enzymatically stable inhibitors of cap-dependent translation. Bioorg. Med. Chem. Lett. 19, 1921-1925, (2009)
  5. Banerjee H., Palenchar J.B., Lukaszewicz M., Bojarska E., Stepinski J., Jemielity J., Guranowski A., Ng S., Wah D.A., Darzynkiewicz E., Bellofatto V.; Identification of the HIT-45 protein from Trypanosoma brucei as an FHIT protein/dinucleoside triphosphatase: Substrate specificity studies on the recombinant and endogenous proteins. RNA 15, 1554-1564, (2009).

    2008:

  6. Tölle M, Jankowski V, Schuchardt M, Wiedon A, Huang T, Hub F, Kowalska J, Jemielity J, Guranowski A, Loddenkemper C, Zidek W, Jankowski J, van der Giet M.Adenosine 5'-Tetraphosphate Is a Highly Potent Purinergic Endothelium-Derived Vasoconstrictor. Circulation Research 108, 1100 - 1108, (2008).
  7. Kowalska J., Lewdorowicz M., Zuberek J., Grudzien-Nogalska E., Bojarska E., Stepinski J., Rhoads R.E., Darzynkiewicz E., Davis R.E., Jemielity J.; Synthesis and Characterization of mRNA Cap Analogs Containing Phosphorothioate Substitutions that Bind Tightly to eIF4E and are Resistant to the Decapping Pyrophosphatase DcpS. RNA 14, 1119-1131 (2008).
  8. Deshmukh MV, Jones BN, Quang-Dang D-U, Flinders J, Floor SN, Kim C, Jemielity J, Kalek M, Darzynkiewicz E, Gross JD.; mRNA Decapping Is Promoted by an RNA-Binding Channel in Dcp2. Molec. Cell 29, 324-336 (2008).

    2007:

  9. Grudzien-Nogalska E, Jemielity J, Kowalska J, Darzynkiewicz E, Rhoads RE.; Phosphorothioate cap analogs stabilize mRNA and increase translational efficiency in mammalian cells. RNA 13, 1745-1755 (2007).
  10. Kowalska J, Lewdorowicz M, Darzynkiewicz E, Jemielity J.; A simple and rapid synthesis of nucleotide analogues containing a phosphorothioate moiety at the terminal position of the phosphate chain. Tetrahedron Lett. 48, 5475-5479 (2007).
  11. Grudzien-Nogalska E, Stepinski J, Jemielity J, Zuberek J, Stolarski R, Rhoads RE, Darzynkiewicz E.; Synthesis of anti-reverse cap analogs (ARCAs) and their applications in mRNA translation and stability. Method Enzymol. 431, 203-227 (2007).
  12. Darzynkiewicz ZM, Bojarska E, Kowalska J, Lewdorowicz M, Jemielity J, Kalek M, Stepinski J, Davis RE, Darzynkiewicz E.; Interaction of human decapping scavenger with 5 ' mRNA cap analogues: structural requirements for catalytic activity. J Phys-Condens Mat. 19 art. no. 285217 (2007)
  13. Zuberek J, Kubacka D, Jablonowska A, Jemielity J, Stepinski J, Sonenberg N, Darzynkiewicz E.; Weak binding affinity of human 4EHP for mRNA cap analogs. RNA 13, 691-697 (2007).
  14. Kowalska J, Lewdorowicz M, Zuberek J, Bojarska E, Stepinski J, Stolarski R, Darzynkiewicz E, Jemielity J.; Assignment of the absolute configuration of P-chiral 5'mRNA cap analogues containing phosphorothioate moiety. Nucleos. Nucleot. Nucl. Acids 26, 1301-1305 (2007).
  15. Jemielity J, Stolarski R, Darzynkiewicz E.; Synthesis of H-3 and C-13 labeled mRNA cap dinucleotides-useful tools for NMR, biochemical, and biological studies. Nucleos. Nucleot. Nucl. Acids 26, 1315-1319 (2007).
  16. Lewdorowicz M, Jemielity J, Kierzek R, Shapira M, Stepinski J, Darzynkiewicz E.; Solid-supported synthesis of 5 '-mRNA cap-4 from trypanosomatids. . Nucleos. Nucleot. Nucl. Acids 26, 1329-1333 (2007).
  17. Wierzchowski J, Pietrzak M, Stepinski J, Jemielity J, Kalek M, Bojarska E, Jankowska-Anyszka M, Davis RE, Darzynkiewicz E.; Kinetics of C elegans DcpS cap hydrolysis studied by fluorescence spectroscopy. Nucleos. Nucleot. Nucl. Acids 26, 1211-1215 (2007).
  18. Lewdorowicz M, Stepinski J, Kierzek R, Jemielity J, Zuberek J, Yoffe Y, Shapira M, Stolarski R, Darzynkiewicz E.; Synthesis of leishmania cap-4 intermediates, cap-2 and cap-3. Nucleos. Nucleot. Nucl. Acids 26, 1339-1348 (2007).
  19. Darzynkiewicz ZM, Bojarska E, Stepinski J, Jemielity J, Jankowska-Anyszka M, Davis RE, Darzynkiewicz E.; Affinity of dinucleotide cap analogues for human decapping scavenger (hdcps). Nucleos. Nucleot. Nucl. Acids 26, 1349-1352 (2007).

    2006:

  20. Kalek M, Jemielity J, Darzynkiewicz ZM, Bojarska E, Stepinski J, Stolarski R, Davis RE, Darzynkiewicz E; Enzymatically Stable 5' mRNA Cap Analogs: Synthesis and Binding Studies with Human DcpS Decapping Enzyme. Bioorganic and Medicinal Chemistry 14, 3223-3230 (2006).
  21. Guranowski A, Starzyńska E, Pietrowska-Borek M, Jemielity J, Kowalska J, Darzynkiewicz E, Thompson MJ, Blackburn MG; Methylene analogues of adenosine-5'-tetraphosphate: their chemical synthesis and recognition by human and plant mononucleoside tetraphosphatases and dinucleoside tetraphosphatases. FEBS Journal 273, 829-838 (2006).
  22. Grudzien E, Kalek M., Jemielity J, Darzynkiewicz E, Rhoads RE; Differential inhibition of mRNA degradation pathways by novel cap analogs. Journal of Biological Chemistry 281, 1857-186 (2006).

    2005:

  23. Westman B, Beeren L, Grudzien E, Stepinski J, Worch R, Zuberek J, Jemielity J, Stolarski R, Darzynkiewicz E, Rhoads RE, Preiss T; The antiviral drug ribavirin does not mimic the 7-methylguanosine moiety of the mRNA cap structure in vitro. RNA 11, 1505-1513 (2005).
  24. Kowalska J, Lewdorowicz M, Zuberek J, Bojarska E, Wojcik J, Cohen LS, Davis RE, Stepinski J, Stolarski R, Darzynkiewicz E, Jemielity J; Synthesis of mRNA cap analogues containing phosphorothioate moiety in 5',5'-triphosphate chain. Nucleos. Nucleot. Nucl. Acids, 24, 595-600 (2005).
  25. Jemielity J, Heinonen P, Lönnberg H, Darzynkiewicz E; Novel approach to solid phase chemical synthesis of oligonucleotide mRNA cap analogues, Nucleos. Nucleot. Nucl. Acids 24, 601-605 (2005).
  26. Kalek M, Jemielity J, Zuberek J, Grudzień E, Bojarska E, Cohen LS, Stepinski J, Stolarski R, Davis RE, Rhoads RE, Darzynkiewicz E; Synthesis and biochemical properties of novel mRNA 5' cap analogs resistant to enzymatic hydrolysis. Nucleos. Nucleot. Nucl. Acids 24, 615-621 (2005).
  27. Jemielity J, Pietrowska-Borek M, Starzynska E, Kowalska J, Stolarski R, Guranowski A, Darzynkiewicz E; Synthesis and Enzymatic Characterization of Methylene Analogs of Adenosine 5'-Tetraphosphate (p4A). Nucleos. Nucleot. Nucl. Acids 24, 589-593 (2005).
  28. Stepinski J, Zuberek J, Jemielity J, Kalek M, Stolarski R, Darzynkiewicz E; Novel Dinucleoside 5',5'-Triphosphate Cap Analogues. Synthesis and Affinity for Murine Translation Factor eIF4E. Nucleos. Nucleot. Nucl. Acids 24, 629-633 (2005).
  29. Kalek M, Jemielity J, Stepinski J, Stolarski R, Darzynkiewicz E; A Direct Method for the Synthesis of Nucleoside 5'-Methylenebis(phosphonate)s from Nucleosides. Tetrahedron Letters 46, 2417-2421 (2005).

    2004:

  30. Lewdorowicz M, Yoffe Y, Zuberek J, Jemielity J, Stepinski J, Kierzek R, Stolarski R, Shapira M, Darzynkiewicz E; Chemical synthesis and binding activity of the trypanosomatid cap-4 structure. RNA 10, 1469-1478 (2004).
  31. Zuberek J, Jemielity J, Jablonowska A, Stepinski J, Dadlez M, Stolarski R, Darzynkiewicz E; Influence of electric charge variation at residues 209 and 159 on the interaction of eIF4E with the mRNA 5 ' terminus. Biochemistry 43, 5370-5379, (2004).

    2003:

  32. Jemielity J, Fowler T, Zuberek J, Stepinski J, Lewdorowicz M, Niedzwiecka A, Stolarski R, Darzynkiewicz E, Rhoads RE. Novel "anti-reverse" cap analogs with superior translational properties. RNA 9, 1108-1122 (2003).
  33. Jemielity J, Stepinski J, Jaremko M, Haber D, Stolarski R, Rhoads RE, Darzynkiewicz E; Synthesis of novel mRNA 5 ' cap-analogues: Dinucleoside P-1, P-3-tri-, P-1, P-4-tetra-, and P-1, P-5-pentaphosphates. Nucleosides Nucleotides & Nucleic Acids 22, 691-694 (2003).
  34. Zuberek J, Jemielity J, Stepinski J, Lewdorowicz M, Niedzwiecka A, Haber D, Stolarski R, Rhoads RE, Darzynkiewicz E; Binding studies of eukaryotic initiation factor eIF4E with novel mRNA dinucleotide cap analogues. Nucleosides Nucleotides & Nucleic Acids 22, 1703-1706 (2003).
  35. Zuberek J, Jemielity J, Niedzwiecka A, Stepinski J, Wyslouch-Cieszynska A, Stolarski R, Darzynkiewicz E; Influence of the length of the phosphate chain in mRNA 5 ' cap analogues on their interaction with eukaryotic initiation factor 4E. Nucleosides Nucleotides & Nucleic Acids 22, 1707-1710 (2003)
  36. Kiraga-Motoszko K, Stepinski J, Niedzwiecka A, Jemielity J, Wszelaka-Rylik M, Stolarski R, Zielenkiewicz W, Darzynkiewicz E; Interaction between yeast eukaryotic initiation factor eIF4E and mRNA 5 ' cap analogues differs from that for murine eIF4E. Nucleosides Nucleotides & Nucleic Acids 22, 1711-1714 (2003)

    1998-2002:

  37. Augustyniak W., Suchecki P., Jemielity J., Kański R., Kańska M.; Synthesis of tritium labelled isotopomers of L-tyrosine. Journal of Labeled Compounds and Radiopharmaceuticals 45 (2002) 559-567.
  38. Jemielity J., Kański R., Kańska M.; Synthesis of tritium labeled [3S-3H]- and [3R-3H]-L- Phenylalanine. Journal of Labeled Compounds and Radiopharmaceuticals 44 (2001) 295-304.
  39. Augustyniak W., Bukowski J., Jemielity J., Kański R., Kańska M.; Ezymatic synthesis of carbon-14 labeled isotopomers of L- phenylalanine. Journal of Radioanalytical Nuclear Chemistry 247 (2000) 371-374.
  40. Lewandowicz A, Jemielity J, Kańska M, Zon J, Paneth P.; Tritium secondary kinetic isotope effect on phenylalanine ammonia-lyase catalyzed reaction. Archives of Biochemistry and Biophysics 370 (1999) 216-221.
  41. Jemielity J., Kańska M., Kański R.; Enzymatic Synthesis of [1-13C]- and [1-14]-L-Phenylalanine. Isotopes in Environmental and Health Studies 34 (1998) 335-339.