Biochemistry

Plan of the lecture:

1. Białka
   1. Struktura I, II, II i IV-rzędowa
   2. Ewolucja molekularna
   3. Systematyka
2. Enzymy
   1. Terminologia i podzial
   2. Kinetyka enzymatyczna - teoria Michaelisa
   3. Mechanizm działania i regulacji
   4. Kompleksy enzymatyczne
3. Metabolizm białek
   1. Enzymy proteolityczne
   2. Transaminacja, dekarboksylacja, dezaminacja oksydacyjna
   3. Cykl mocznikowy
   4. Oksydacyjna dekarboksylacja a-ketokwasów
4. Kwasy nukleinowe
   1. Struktura I-rzędowa, struktura II i III-rzędowa DNA i RNA: tRNA, mRNA, rRNA
   2. Biosynteza z prekursorów
   3. Enzymy rozszczepiające kwasy nukleinowe
   4. Funkcje genetyczne:
      • replikacja DNA:
      • rynteza RNA (transkrypcja)
      • procesowanie RNA
      • geny mozaikowe
      • transfer informacji genetycznej
      • kod genetyczny
      • biosynteza bialek (translacja)
5. Wirusy: budowa, cykl życiowy i patagenność; wirus HIV
6. Węglowodany
   1. Mono-, di- i polisacharydy, hydroliza i foaforylacja
   2. Glikozydy
   3. Metabolizm węglowodanów
      • hydroliza i fosforoliza polisacharydow
      • glikoliza, fermentacja i glukoneogeneza
      • fosforylacja substratowa
      • cykl Krebsa
      • cykl pentozowy
      • fotosynteza, cykl Calvina
7. Budowa i metabilizm lipidów
8. Utleniane biologiczne i podstawy bioenergetyki
   1. Rola ATP
   2. Łańcuch oddechowy
   3. Mechanizm fosforylacji oksydacyjnej Mitchella
   4. Mitochondrium
9. Fotosynteza
10. Biochemia organelli komórkowych
    1. Lokalizacja procesów biochemicznych
    2. Błona komórkowa i transport błonowy
    3. Współzależnosci metaboliczne i regulacja metabolizmu
       1. Etapy katabolizmu komórkowego (tlenowy i beztlenowy)
       2. Wymiana metabolitów między cyklem Krebsa a pulą bialek, węglowodanów i lipidów
    4. Regulacja metabolizmu
       1. Model Jacoba-Monod
       2. Regulacja na poziomie genetycznym
       3. Endogenne regulatory allosteryczne
       4. Sygnalizacja międzykomórkowa
    5. Regulacja hormonalna
    6. Układ nerwowy: przewodzenie, neurotransmitery, rola jonów wapnia i kalmoduliny.

Literature:

1. L. Stryer: Biochemia
2. B. Alberts i wsp.: Podstawy biologii komórki. Wprowadzenie do biologii molekularnej. PWN, Warszawa 1999.
3. T. A. Brown: Genomy. PWN, Warszawa 2001